Если верить одному из президентов студии Naughty Dog Эвану Уэллсу, то первый прототип Uncharted: Drake’s Fortune очень напоминал собой Bioshock, ведь действие игры проходило в подводном бункере. Всё это было связано с разработанной студией Naughty Dog технологией воды, которую она хотела показывать и показывать. Однако вскоре руководство компании приняло решение перенести действие Uncharted: Drake’s Fortune на тропический остров, а история с подводным бункером так и осталась нереализованным прототипом.

Забавным фактом является то, что создатель Bioshock Кен Левайн в одном из своих интервью заявил, что на раннем этапе разработки игры они планировали перенести действие Bioshock на тропический остров.